Уроженец города Костшин на границе с Германией, до соседней страны, в отличие от многих партнеров по сборной, Войтковяк пока не доехал. Последние годы Войтковяк удачно выступает в "Лехе" из Познани на правом фланге обороны, хотя может выйти и в центре. В сборной является дублером Лукаша Пищека.

Войтковяк начинал карьеру в "Целулозе" из родного Костшина, а продолжил в "Амике" из Вронки. С 2006 года играет за "Лех", в апреле 2009 года дебютировал в составе сборной Польши.