Себастьян Бёниш вырос в Германии, однако долго не решался принять приглашение родной сборной, хотя имел шанс поехать на Евро-2008. Лишь когда перед ним замаячила перспектива сыграть на домашнем первенстве Европы, он принял приглашение Францишека Смуды. В 2009 году Бёниш выиграл в составе молодежной команды Германии чемпионат Европы.

Вскоре после дебюта в сборной Польши Бениш осень 2010 года получил тяжелую травму колена, из-за которой пропустил почти год и в результате потерял место в составе "Вердера". В сборной будет конкурировать с более опытным Якубом Вавжиняком на позиции левого защитника (хотя может сыграть и справа). Для крайнего защитника обладает очень высоким ростом.

В свободное время увлекается бильярдом и кино.